循环水腐蚀会引起换热设备报废。一般能通过添加缓蚀剂、提高循环水的 pH值等方法控制腐蚀。
为了减轻环境富营养化的压力，常用添加有机膦酸盐和低磷缓蚀剂、复合缓蚀剂的方法来解决。严格控制循环水的 pH 值，使金属表面生成氧化性保护膜来减少设备腐蚀。
其中微生物、黏泥、藻类循环水中溶有充足的氧气、合适的温度及富养条件，适合微生物的生长繁殖。
须严格控制水中微生物含量、黏泥量、藻类数量，否则循环水水质会恶化、发臭、变黑。主要通过控制水质、加强旁滤、投加杀菌剂和剥离剂进行调整。
控制微生物有效和常用的方法之一是向冷却水系统中添加杀菌剂，当水中余氯质量浓度在0.5~1 mg /L 时才有杀菌效果。
添加杀菌剂或剥离剂需要注意空分( 制氧) 循环水不能加会起泡的杀菌剥离剂。投加后循环水浊度会不断上升，要每隔 2 ～ 3 h 进行跟踪分析。当浊度上升到至高点时，可通过反洗旁滤器排水来降低。
中浩远达建议冷却水系统进行剥离和清洗后再投加杀菌剂的方案要比只添加杀菌剂的方案有效得多。