目前的反渗透膜元件清洗中，离线清洗作为有效的处理反渗透膜元件污染的手段已经得到了广大反渗透用户的接受，而且正在成为越来越重要的反渗透膜元件的清洗手段，与在线清洗相比较，离线清洗有着下列优势：
（1）在线清洗过程中，设备需要停止产水运行，处于清洗循环状态，直至清洗结束为止，才能转入正常运行；
离线清洗过程中有替换膜在设备中保证连续正常产水，不会因为清洗过程中突发情况或时间延长而影响设备运行。替换膜的性能一般不能低于在线运行的膜元件。
（2）在线清洗过程中，整支膜壳中的几支膜元件串联清洗，前端膜元件清洗下来的污染物须经过后端的每一支膜元件后才能排出，使得清洗不彻底，且会形成交叉污染情况；
离线清洗为单质膜元件单独清洗，污染物直接清理膜元件，不会造成串联污染。
（3）在线清洗过程中，只能通过运行数据对清洗系统状态有一个大致的了解；
离线清洗中可以直观对整个膜壳及每一支膜元件的状态进行具体分析，以使系统运行得到更好的完善。
（4）在线清洗过程中，只能根据整个系统运行状况进行方案定制和清洗操作，每一次清洗只能用一种药剂对系统中所有膜元件进行清洗，且清洗时间、清洗温度、清洗条件一样；
离线清洗可真对膜元件在系统中的位置、污染情况、污染程度的不同以及膜元件的性能衰减情况，选择不同清洗药剂，制定不同清洗方案，随时调整清洗措施、药剂种类、药量及清洗顺序，以达到较大程度的彻底清洗恢复。
（5）通过在线清洗，只能部分恢复整个系统的运行状态；离线清洗不仅可恢复每支膜元件性能，并且可以在测试过程中对膜元件进行性能筛选，将以不可用的膜元件挑出。
（6）在线清洗过程中，清洗液充满整个系统，使从污染物严重的膜元件上剥离下来的污染物重新循环至系统，对比较干净的膜元件造成二次污染的隐患；
离线清洗可根据污染程度不同将不同膜元件分类清洗，保证每支膜元件清洗彻底。
（7）在线清洗过程中，要达到清洗效果通常只能加大药剂用量，或延长清洗时间，通过化学作用对污垢进行溶解性清洗，这就会对膜元件的安全造成一定威胁，而对一些不溶性的机械杂质没有任何作用；
离线清洗可以增加清洗流量，通过对单质膜元件进行正反向大流量冲洗，可大限度的将污染物冲出膜体。