清洗液的选择和使用
选择适宜的化学清洗药剂及合理的清洗方案涉及许多因素。
首先要确定主要的污染物，选择合适的化学清洗药剂。有时针对某种特殊的污染物或污染状况，要使用RO药剂制造商的专用化学清洗药剂，并且在应用时要遵循药剂供应商提供的产品性能及使用说明。有的时候可针对具体情况，从反渗透装置取出已发生污染的单支膜元件进行测试和清洗试验，以确定合适的化学药剂和清洗方案。
为达到最佳的清洗效果，有时会使用一些不同的化学清洗药剂进行组合清洗。
典型的程序是先在低pH值范围的情况下进行清洗，去除矿物质垢污染物，然后再进行高pH值清洗，去除有机物。有些清洗溶液中加入了洗涤剂以帮助去除严重的生物和有机碎片垢物，同时，可用其它药剂如EDTA螯合物来辅助去除胶体、有机物、微生物及硫酸盐垢。
需要慎重考虑的是如果选择了不适当的化学清洗方法和药剂，污染情况会更加恶化。
化学清洗药剂的选择及使用准则
选用的专用化学药剂，首先要确保其已由化学供应商认定并符合用于膜元件的要求。
如果正在使用指定的化学药剂，要确认其已符合膜元件的要求；
采用组合式方法完成清洗工作，包括适宜的清洗pH、温度及接触时间等参数，这将会有利于增强清洗效果；
在推荐的最佳温度下进行清洗，以求达到最好的清洗效率和延长膜元件寿命的效果；
以最少的化学药剂接触次数进行清洗，对延续膜寿命有益；
谨慎地由低至高调节pH值范围，可延长膜元件的使用寿命。pH范围为2~12（勿超出）；
典型的、最有效的清洗方法是从低pH至高pH溶液进行清洗。但对油污染膜元件的清洗不能从低pH值开始，因为油在低pH时会固化；
清洗和冲洗流向应保持相同的方向；
当清洗多段反渗透装置时，最有效的清洗方法分段清洗，这样可控制最佳清洗流速和清洗液浓度，避免前段的污染物进入下游膜元件；
用较高pH产品水冲洗洗涤剂可减少泡沫的产生；
如果系统已发生生物污染，就要考虑在清洗之后，加入一个杀菌剂化学清洗步骤。杀菌剂必须在清洗后立即进行，也可在运行期间定期进行（如一星期一次）连续加入一定的剂量。必须确认所使用的杀 菌剂与膜元件相容，不会带来任何对人的健康有害的风险，并能有效地控制生物活性，且成本低；
为保证安全，溶解化学药品时，切记要慢慢地将化学药剂加入充足的水中并同时进行搅拌；
从安全方面考虑，不能将酸与苛性（腐蚀性）物质混合。在要使用下一种溶液之前，从RO系统中彻底冲洗干净滞留的前一种化学清洗溶液。
清洗液的选择
常规清洗液配方提供的清洗溶液是将一定重量（或体积）的化学药品加入到100加仑（379升）的洁净水中（RO产品水或不含游离氯的水）。溶液是按所用化学药品和水量的比例配制的。溶剂是RO产品水或去离子水，无游离氯和硬度。清洗液进入膜元件之前，要求彻底混合均匀，并按照目标值调pH值且按目标温度值稳定温度。常规的清洗方法基于化学清洗溶液循环清洗一小时和一种任选的化学药剂浸泡一小时的操作而设定的。
常规清洗液介绍
1、溶液1
2.0%（W）柠檬酸（C6H8O7）的低pH清洗液。用于去除无机盐垢（如碳酸钙垢、硫酸钙、硫酸钡、硫酸锶垢等）、金属氧化物/氢氧化物（铁、锰、铜、镍、铝等）及无机胶体十分有效。
2、溶液2
0.5%（W）盐酸低pH清洗液，主要用于去除无机物垢（如碳酸钙垢、硫酸钙、硫酸钡、硫酸锶垢等），金属氧化物/氢氧化物（铁、锰、铜、镍、铝等），及无机胶体。这种清洗液比溶液1要强烈些，因为盐酸（HCl）是强酸。
3、溶液3
0.1%（W）氢氧化钠高pH清洗液。用于去除聚合硅垢。这一洗液是一种较为强烈的碱性清洗液。